MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 1386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015184	CG	3	6	205598	205603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015184	T	7	7	205646	205652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015184	GCC	2	6	205698	205703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_015184	TGA	2	6	205710	205715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015184	AGG	2	6	205772	205777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015184	GA	3	6	206328	206333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015184	GGT	2	6	206637	206642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015184	GA	3	6	206649	206654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015184	GCA	2	6	206664	206669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015184	GGT	2	6	206670	206675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015184	CAGTG	2	10	206679	206688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_015184	TTC	2	6	206948	206953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015184	GCT	2	6	207031	207036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015184	GAT	2	6	207041	207046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015184	CG	3	6	207108	207113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_015184	TATT	2	8	209396	209403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015184	T	7	7	209444	209450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015184	GGATT	2	10	209521	209530	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015184	TGGA	2	8	209548	209555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015184	GC	3	6	209882	209887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_015184	CCG	2	6	210730	210735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015184	ATGA	2	8	210757	210764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015184	CTTC	2	8	211141	211148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_015184	TGAAG	2	10	211731	211740	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015184	TGTC	2	8	213066	213073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_015184	CTT	2	6	213575	213580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015184	TCC	2	6	215395	215400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015184	GAT	2	6	216302	216307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015184	AACG	2	8	216318	216325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015184	CGTT	2	8	216356	216363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_015184	AGC	2	6	216420	216425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015184	ACGG	2	8	216687	216694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_015184	TTC	2	6	216695	216700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015184	GGCT	2	8	216827	216834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_015184	AGC	2	6	216884	216889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015184	CG	3	6	216905	216910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_015184	CGGTT	2	10	217192	217201	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_015184	A	7	7	218291	218297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015184	CAC	2	6	218353	218358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015184	GAG	3	9	218386	218394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015184	AAC	2	6	219351	219356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015184	CCTG	2	8	219361	219368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015184	AGGGG	2	10	219391	219400	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015184	TGC	2	6	219405	219410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015184	ACG	2	6	219447	219452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015184	GTC	2	6	221084	221089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015184	TGGG	2	8	221211	221218	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015184	TGA	2	6	221227	221232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015184	ACA	2	6	221252	221257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015184	AT	4	8	221305	221312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015184	GCG	2	6	221400	221405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015184	CTG	2	6	221408	221413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015184	GC	3	6	222362	222367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_015184	GATC	2	8	222439	222446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015184	GGCGC	2	10	222447	222456	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
556	NC_015184	GGA	2	6	222633	222638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015184	AGC	2	6	222656	222661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015184	TCA	2	6	222717	222722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015184	TTCT	2	8	223317	223324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_015184	AACC	2	8	223325	223332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015184	ATC	2	6	224066	224071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015184	CAT	2	6	224088	224093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015184	GTAA	2	8	224763	224770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015184	TGG	2	6	225451	225456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015184	AAG	2	6	225460	225465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015184	AG	3	6	225675	225680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015184	GACT	2	8	225729	225736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_015184	CTT	2	6	225811	225816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015184	CAT	2	6	225862	225867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015184	TC	3	6	225946	225951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_015184	GCG	2	6	229803	229808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015184	GTG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015184	CAA	2	6	229900	229905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015184	TGG	2	6	229925	229930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015184	GCC	2	6	229956	229961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015184	GTT	2	6	230923	230928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015184	TAG	2	6	230939	230944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015184	AGT	2	6	231793	231798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015184	CAC	2	6	233959	233964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015184	ATAC	2	8	233986	233993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015184	CAG	2	6	234015	234020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_015184	GCG	2	6	234086	234091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015184	TTC	2	6	234095	234100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015184	CTA	2	6	234112	234117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015184	CGGG	2	8	234945	234952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
586	NC_015184	CTT	2	6	234975	234980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015184	CG	3	6	235055	235060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015184	CTT	2	6	235102	235107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015184	GTC	2	6	237263	237268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015184	CAG	2	6	237344	237349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015184	CTTT	2	8	237393	237400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_015184	AGC	2	6	237414	237419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015184	CGC	3	9	239108	239116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_015184	AGC	2	6	239213	239218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015184	GCTTGG	2	12	239225	239236	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_015184	CGT	2	6	239262	239267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015184	CAT	2	6	239300	239305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015184	A	6	6	239316	239321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015184	GGC	2	6	239518	239523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015184	GCC	2	6	239584	239589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_015184	TGG	2	6	239639	239644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015184	GTT	2	6	240365	240370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015184	AAC	2	6	240414	240419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015184	AGG	2	6	240507	240512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015184	TCA	2	6	242132	242137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015184	TTGGC	2	10	242174	242183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
607	NC_015184	ACC	2	6	242325	242330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015184	AGGC	2	8	242348	242355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_015184	ATTG	2	8	243597	243604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015184	CTG	2	6	243640	243645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015184	CCG	2	6	243949	243954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_015184	ATTCC	2	10	243961	243970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
613	NC_015184	CAG	2	6	243975	243980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015184	GATCA	2	10	244038	244047	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
615	NC_015184	CGG	2	6	244136	244141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015184	CGA	2	6	244180	244185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015184	CCG	2	6	245572	245577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015184	AAG	2	6	245614	245619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015184	CTC	2	6	245620	245625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015184	GAT	2	6	245668	245673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015184	GTCC	2	8	245679	245686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015184	CGCT	2	8	245741	245748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015184	GCGCTC	2	12	245788	245799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
624	NC_015184	CGT	2	6	247592	247597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015184	ATT	2	6	247658	247663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015184	ATT	2	6	247681	247686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015184	ATTC	2	8	247688	247695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_015184	TGC	2	6	254320	254325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015184	CAT	2	6	254369	254374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015184	CGG	2	6	255741	255746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015184	GAT	2	6	255923	255928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015184	ATG	2	6	256032	256037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015184	CCG	2	6	256065	256070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_015184	GCA	2	6	256381	256386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015184	CAG	2	6	256451	256456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015184	TTC	2	6	257091	257096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015184	GACAC	2	10	257875	257884	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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769	NC_015184	AAT	2	6	311574	311579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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